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Un effetto collaterale dell'intervento diretto che si è reso necessario per la Seconda Fondazione è che questa ha dovuto scoprirsi, rivelando la sua esistenza ai membri della Prima Fondazione, che dopo la morte del Mulo ha riacquistato la sua indipendenza. A questo punto appaiono nella storia il dottor Darell, figlio di Toran e Bayta Darell, e sua figlia Arcadia. Darell guida un gruppo di scienziati e intellettuali della Prima Fondazione che cercano di contrastare la Seconda Fondazione, interpretando il suo proposito di correggere la deviazione dal Piano Seldon come un illecito tentativo di dominio della loro volontà. Trovano infatti le prove del condizionamento mentale al quale sono stati sottoposti alcuni membri della classe dirigente, e si mettono alla sua ricerca per distruggerla.

Dato che una delle condizioni fondamentali per la riuscita del Piano Seldon era che le masse fossero ignare del loro condizionamento e del corso futuro degli eventi, gli uomini della Seconda Fondazione mettono a punto un progetto per correggere questa ulteriore deviazione dal Piano. Innanzitutto, uno dei suoi membri, Lady Callia, riesce a infiltrarsi su Kalgan e a diventare la donna del signore del pianeta, Stettin, inducendolo a dichiarare contro la Prima Fondazione una guerra che questa sarebbe stata destinata a vincere, con l'obiettivo di far riacquistare ai suoi membri la fiducia nelle proprie possibilità dopo il presunto fallimento del piano di Hari Seldon. Un altro membro, Anthor, si infiltra nello stesso gruppo di Darell, che nel frattempo ipotizza che Kalgan sia la vera sede della Seconda Fondazione. La svolta definitiva agli eventi la dà il Primo Oratore, Preem Palver, che, sotto le spoglie di un mercante agricolo, interviene personalmente cavando d'impaccio Arcadia da una situazione difficile in cui si era cacciata su Kalgan, e portandola con sé al sicuro su Trantor. Qui Arcadia, nell'attesa che la guerra finisca per poter tornare a casa, ha un'intuizione sulla sede della Seconda Fondazione, e tramite Preem Palver fa riferire al padre una frase rivelatrice: "un circolo non ha un capo". Questa fa riferimento alla forma a doppia spirale della Galassia, che percorrendo lungo la circonferenza conduce allo stesso punto di partenza, indicando quindi che la Seconda Fondazione è stata creata su Terminus e tenuta nascosta, per seguire da vicino e indirizzare lo sviluppo della Prima. Tutto ciò viene confermato da Anthor quando viene scoperto, e la ricerca porterà a scovare e neutralizzare 50 uomini della Seconda Fondazione su Terminus, convincendo la Prima Fondazione di essere rimasta ormai l'unica.